RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	MEI4	A8MW99	385 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SEMA4F	O95754	770 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SERPINF2	P08697	491 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ENG	P17813	658 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	DPP6	P42658	865 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	LINGO4	Q6UY18	593 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	TMC6	Q7Z403	805 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PARVA	Q9NVD7	372 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SARDH	Q9UL12	918 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PP55	124 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RHOQ	P17081	205 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SLC8A1	P32418	973 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ACVRL1	P37023	503 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	NNMT	P40261	264 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ZBED6	P86452	979 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	NFKBIB	Q15653	356 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ACCSL	Q4AC99	568 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	USP30	Q70CQ3	517 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CEP76	Q8TAP6	659 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ISCU	Q9H1K1	167 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	TSPY26P	Q9H489	355 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	FZD10	Q9ULW2	581 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ANKRD62	A6NC57	917 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	C10orf142	B7Z368	130 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PLK4	O00444	970 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RTN2	O75298	545 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	DRD3	P35462	400 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	MAPK8	P45983	427 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	KRT83	P78385	493 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	GNA12	Q03113	381 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SEMA3B	Q13214	749 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	GANC	Q8TET4	914 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ZNF653	Q96CK0	615 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SPON2	Q9BUD6	331 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SGK2	Q9HBY8	427 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SCML1	Q9UN30	329 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RNF103	O00237	685 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CBX4	O00257	560 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CD160	O95971	181 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	IL1B	P01584	269 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PSMA2	P25787	234 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	L1CAM	P32004	1257 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ARF5	P84085	180 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	IL31	Q6EBC2	164 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	RNF214	Q8ND24	703 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PEBP4	Q96S96	227 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	DNAI1	Q9UI46	699 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		21.36	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ADH1B	P00325	375 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	SERPING1	P05155	500 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	IGHV4-34	P06331	123 aa		21.35	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	CTSL	P07711	333 aa		21.35	■■□□□ 1.01

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