RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 VPS39Q96JC1 886 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 FAM161BQ96MY7 647 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 ZNF570Q96NI8 536 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 AGAP3Q96P47 875 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 GPR22Q99680 433 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 CEP41Q9BYV8 373 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 TSC2P49815 1807 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-205ENST00000546891 A0A0U1RQF3 1178 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 WASH4PA8MWX3 477 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 F5H423 210 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ATP9BO43861 1147 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ENTPD5O75356 428 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CABYRO75952 493 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KITP10721 976 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 GM2AP17900 193 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CRABP2P29373 138 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SERPINB5P36952 375 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 COPAP53621 1224 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 AP2B1P63010 937 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 IRX4P78413 519 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 HTRA3P83110 453 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ZBTB17Q13105 803 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ITGA9Q13797 1035 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 DSC3Q14574 896 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 GNASQ5JWF2 1037 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TREML1Q86YW5 311 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 NPWQ8N729 165 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TTC8Q8TAM2 541 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ADAM32Q8TC27 787 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SUSD3Q96L08 255 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SERPINB11Q96P15 392 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KCNK16Q96T55 309 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PKMYT1Q99640 499 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 IL12RB2Q99665 862 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CDH19Q9H159 772 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 VCX3BQ9H321 246 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ARMCX1Q9P291 453 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PSAT1Q9Y617 370 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 A0A087X1B8 175 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 MATN3O15232 486 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 MAP3K7O43318 606 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SIN3BO75182 1162 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 B3GAT3O94766 335 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 JCHAINP01591 159 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CHRNA1P02708 482 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 C2P06681 752 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CTSHP09668 335 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CYBAP13498 195 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 BDNFP23560 247 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 IDH3AP50213 366 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 FCGRTP55899 365 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ACTR3P61158 418 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SREBF2Q12772 1141 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PRKAA1Q13131 559 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SLC12A1Q13621 1099 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 FAM26DQ5JW98 314 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms