RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545889.5

CLIP1-218, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLIP1, Length 4,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-218ENST00000545889 LZTR1Q8N653 840 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CXorf38Q8TB03 319 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SEMA4DQ92854 862 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 ULBP1Q9BZM6 244 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SEPT3Q9UH03 358 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 OR6C75A6NL08 312 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 TSPAN1O60635 241 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 GUCA1CO95843 209 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 NUDT14O95848 222 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 F2P00734 622 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 PCYT1AP49585 367 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 PMS2P54278 862 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 USP45Q70EL2 814 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CASP10Q92851 521 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 MPP4Q96JB8 637 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 AMACRQ9UHK6 382 aa8.76□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 A0A088AWK7 358 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 GOLGA8RI6L899 631 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 PRMT3O60678 531 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 FGF19O95750 216 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CFIP05156 583 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 USP17L7P0C7H9 530 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CCL5P13501 91 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CYP2C18P33260 490 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 WASP42768 502 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 GHRHRQ02643 423 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 FIGNQ5HY92 759 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 JAMLQ86YT9 394 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 NAT16Q8N8M0 369 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 NRBF2Q96F24 287 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 C9orf72Q96LT7 481 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 THAP2Q9H0W7 228 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 STK39Q9UEW8 545 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SNX12Q9UMY4 172 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 ALG6Q9Y672 507 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 COL1A2P08123 1366 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 E2F8A0AVK6 867 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 MGAT4DA6NG13 374 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 F8VP50 259 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 KRT16P08779 473 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CLTBP09497 229 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 FUT4P22083 530 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 MED21Q13503 144 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SLC9A5Q14940 896 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 TEAD4Q15561 434 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 GPR135Q8IZ08 494 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 TADA1Q96BN2 335 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SCLYQ96I15 445 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 FICDQ9BVA6 458 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 ACTR8Q9H981 624 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 AHSPQ9NZD4 102 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SYCE1LA8MT33 242 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 GLP2RO95838 553 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 RRM1P23921 792 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 GPR1P46091 355 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 NAB2Q15742 525 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 NFIL3Q16649 462 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 UBP1Q9NZI7 540 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.75□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.74□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 SMAPO00193 183 aa8.74□□□□□ -1.01
CLIP1-218ENST00000545889 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms