RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 PPIP5K2O43314 1243 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GGPS1O95749 300 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ETS2P15036 469 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 F8A1P23610 371 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CCR1P32246 355 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ALDH1A3P47895 512 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FNTBP49356 437 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ARF5P84085 180 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TCP10Q12799 353 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 KCNJ12Q14500 433 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SSX2Q16385 188 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CERS5Q8N5B7 392 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 MLKLQ8NB16 471 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 LPGAT1Q92604 370 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 NT5C1BQ96P26 610 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CYTH2Q99418 400 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TREM1Q9NP99 234 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 NYAP2Q9P242 653 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FLT1P17948 1338 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 A0A1W2PPW3 197 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PLA2G6O60733 806 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 DHFRP00374 187 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PLATP00750 562 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 NPY2RP49146 381 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GLO1Q04760 184 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FOXO1Q12778 655 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 MTMR1Q13613 665 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FIGNQ5HY92 759 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SFR1Q86XK3 245 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PANX2Q96RD6 677 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CLIC4Q9Y696 253 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 A0A1B0GVC2 190 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SMIM23A6NLE4 172 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TMEM210A6NLX4 147 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TRAF5O00463 557 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 DCLK1O15075 740 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CLDN3O15551 220 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PROM1O43490 865 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 KRT37O76014 449 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 MYO1DO94832 1006 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PGM3O95394 542 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SLURP2P0DP57 97 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PF4V1P10720 104 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TYK2P29597 1187 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 RRM2P31350 389 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PCGF2P35227 344 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PPM1AP35813 382 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CPA2P48052 419 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CDK7P50613 346 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GNG11P61952 73 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PRKCQQ04759 706 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SQSTM1Q13501 440 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 DHCR24Q15392 516 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SEC23AQ15436 765 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 DUPD1Q68J44 220 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CREG2Q8IUH2 290 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 COG1Q8WTW3 980 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 MAP6Q96JE9 813 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.29□□□□□ -1.4
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