RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	TGM5	O43548	720 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	HCRT	O43612	131 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ATP2C2	O75185	946 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	C1R	P00736	705 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PAEP	P09466	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SKIL	P12757	684 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC130	P13994	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LMO2	P25791	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ANXA13	P27216	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KLK7	P49862	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PDE6C	P51160	858 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CLCN4	P51793	760 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RAD23B	P54727	409 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	BPIFB4	P59827	614 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	APBA1	Q02410	837 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	HYAL1	Q12794	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GPR17	Q13304	367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PLD1	Q13393	1074 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM14	Q14142	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TAF12	Q16514	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SHC3	Q92529	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CASP10	Q92851	521 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KAT5	Q92993	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CEP72	Q9P209	647 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MYO9B	Q13459	2157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	EPHB6	O15197	1021 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	THAP12	O43422	761 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	KRT37	O76014	449 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	GFPT2	O94808	682 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	ABLIM3	O94929	683 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNHG1-208	ENST00000538266	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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