RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 USP33Q8TEY7 942 aa27.09■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 ABCB8Q9NUT2 735 aa27.09■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 LIMD1Q9UGP4 676 aa27.09■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 NEBLO76041 1014 aa27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 STK10O94804 968 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 OXCT1P55809 520 aa27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 LMAN2Q12907 356 aa27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 NR1H3Q13133 447 aa27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 LEXMQ3ZCV2 418 aa27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 GTSE1Q9NYZ3 720 aa27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 MARK1Q9P0L2 795 aa27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
NDUFS3-211ENST00000533507 CD70P32970 193 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ETFBP38117 255 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 HTR4Q13639 388 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 CPA6Q8N4T0 437 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 NSMCE1Q8WV22 266 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 SLCO2A1Q92959 643 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 FEM1AQ9BSK4 669 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 RAB17Q9H0T7 212 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 DPH5Q9H2P9 285 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 BRD9Q9H8M2 597 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 HPS4Q9NQG7 708 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 CHADO15335 359 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 GLDCP23378 1020 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ADCY8P40145 1251 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 RUNX3Q13761 415 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF783Q6ZMS7 281 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC110Q8TBZ0 833 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 TSGA13Q96PP4 275 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 EPB41L5Q9HCM4 733 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 PRDM6Q9NQX0 595 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 TTLL3Q9Y4R7 772 aa27.07■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 RNF103O00237 685 aa27.06■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 JCHAINP01591 159 aa27.06■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 CLCN6P51797 869 aa27.06■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 APCDD1Q8J025 514 aa27.06■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 PLCD3Q8N3E9 789 aa27.06■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ERP44Q9BS26 406 aa27.06■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 UQCRHLA0A096LP55 91 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ESYT3A0FGR9 886 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ANHXE9PGG2 379 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 MATN3O15232 486 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 MTSS1O43312 755 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 UQCRHP07919 91 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 CCNB1P14635 433 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 HLA-FP30511 346 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 GPS1Q13098 491 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 AAK1Q2M2I8 961 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 PID1Q7Z2X4 250 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 AGAP3Q96P47 875 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM50BQ9Y247 325 aa27.05■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 TRIM24O15164 1050 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 KDELR3O43731 214 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 IL10RBQ08334 325 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 PTK6Q13882 451 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ELF2Q15723 593 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 PCDH9Q9HC56 1237 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 SNX24Q9Y343 169 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 F5H423 210 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 CTIFO43310 598 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 SNAP91O60641 907 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 IL9P15248 144 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 PTPN3P26045 913 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 RPL22P35268 128 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF33AQ06730 810 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 WASHC5Q12768 1159 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ZBTB17Q13105 803 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 CCHCR1Q8TD31 782 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 IFT81Q8WYA0 676 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 KCNK12Q9HB15 430 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 GGA2Q9UJY4 613 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ACTL7AQ9Y615 435 aa27.04■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 PRAMEF11O60813 436 aa27.03■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 DGKGP49619 791 aa27.03■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 P3H1Q32P28 736 aa27.03■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 LINGO4Q6UY18 593 aa27.03■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 C12orf40Q86WS4 652 aa27.03■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
NDUFS3-211ENST00000533507 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms