RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 USP25Q9UHP3 1055 aa4.61□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PADI3Q9ULW8 664 aa4.61□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.61□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TET1Q8NFU7 2136 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CFAP69A5D8W1 941 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 F8W8V4 182 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PJA2O43164 708 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ERLIN2O94905 339 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LYPLA2O95372 231 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 C22orf31O95567 290 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CHRNA1P02708 482 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MYF5P13349 255 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KCNA5P22460 613 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PEX2P28328 305 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 IL12RB1P42701 662 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 QARSP47897 775 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MCM2P49736 904 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CLRN1P58418 232 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM189BP81408 668 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FGL2Q14314 439 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KYAT1Q16773 422 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM266Q2M3C6 531 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PRR16Q569H4 304 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MARCH8Q5T0T0 291 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MIER3Q7Z3K6 550 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 C4orf19Q8IY42 314 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 THNSL1Q8IYQ7 743 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KRT78Q8N1N4 520 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TMIEQ8NEW7 156 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 GDPD5Q8WTR4 605 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PPM1EQ8WY54 764 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LRTOMTQ8WZ04 291 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MBOAT7Q96N66 472 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CPVLQ9H3G5 476 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SPG21Q9NZD8 308 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KCND2Q9NZV8 630 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MAFFQ9ULX9 164 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRSQ13332 1948 aa4.6□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CDH23Q9H251 3354 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DRGXA6NNA5 263 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 INPPL1O15357 1258 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM20BO75063 409 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ATP9AO75110 1047 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJB5O75953 348 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 BMP15O95972 392 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 HK1P19367 917 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PROZP22891 400 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MARK3P27448 753 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ADRA1BP35368 520 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KRT2P35908 639 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MAGEA9P43362 315 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 EFNA5P52803 228 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NOMO3P69849 1222 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM193AP78312 1265 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FMO1Q01740 532 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PRKCEQ02156 737 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SP4Q02446 784 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 GPNMBQ14956 572 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2SQ16763 222 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RABL3Q5HYI8 236 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 EFCAB12Q6NXP0 572 aa4.59□□□□□ -1.67
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