RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHOC	P08134	193 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD59	P13987	128 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	RRM1	P23921	792 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKCI	P41743	596 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMD8	P48556	350 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	GALC	P54803	685 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZVU0	165 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUC3B	Q9H195	1237 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRY	Q5TBA9	3013 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACACB	O00763	2458 aa		13.02	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ILVBL	A1L0T0	632 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLK4	O00444	970 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.02	□□□□□ -0.33	2e-6	■■■■■ 31.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCP110	O43303	1012 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRIG2	O94898	1065 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD160	O95971	181 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTSL	P07711	333 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNS	P15586	552 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOT1	P17174	413 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPD1	P21695	349 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	C5AR1	P21730	350 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	PML	P29590	882 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADPRH	P54922	357 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARF5	P84085	180 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	FANCC	Q00597	558 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCAP	Q12770	1279 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINGO4	Q6UY18	593 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEFB124	Q8NES8	71 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	VOPP1	Q96AW1	172 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL21R	Q9HBE5	538 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	FZD4	Q9ULV1	537 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM131	Q92545	1883 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCF2L	O15068	1137 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	FSBP	O95073	299 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADH1B	P00325	375 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL1B	P01584	269 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYP	P08247	313 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1E1	P30953	314 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACVRL1	P37023	503 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	NNMT	P40261	264 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASIC2	Q16515	512 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	LAYN	Q6UX15	382 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM7	Q9C029	511 aa		13.01	□□□□□ -0.33

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