RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 AP3B1O00203 1094 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 COPEO14579 308 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MATN3O15232 486 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PSMD3O43242 534 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 USP12O75317 370 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SOAT2O75908 522 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 USP1O94782 785 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJB2P25686 324 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NPY2RP49146 381 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 EFEMP1Q12805 493 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.075e-6■■■■□ 19.6
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PDE4D-208ENST00000502484 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PRPSAP1Q14558 356 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RASIP1Q5U651 963 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 VWCEQ96DN2 955 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV3-27P01718 113 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FGBP02675 491 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LIG3P49916 1009 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MGAT5Q09328 741 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CDH17Q12864 832 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IKBKEQ14164 716 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MROH9Q5TGP6 573 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RNF43Q68DV7 783 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PACS1Q6VY07 963 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00523Q86TU6 105 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 USP33Q8TEY7 942 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CERS2Q96G23 380 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FCRL5Q96RD9 977 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DONSONQ9NYP3 566 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MPP6Q9NZW5 540 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MYO9BQ13459 2157 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEB16A2A368 324 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RHOQP17081 205 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NDST2P52849 883 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RING1Q06587 406 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DUSP4Q13115 394 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PSMD5Q16401 504 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM240Q5SV17 173 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.36□□□□□ -1.07
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PDE4D-208ENST00000502484 PPM1EQ8WY54 764 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FATE1Q969F0 183 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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PDE4D-208ENST00000502484 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IL22Q9GZX6 179 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GLOD4Q9HC38 313 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZFATQ9P243 1243 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.36□□□□□ -1.07
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