RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TTC21B-208	ENST00000497425	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TTC21B-208	ENST00000497425	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TTC21B-208	ENST00000497425	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TTC21B-208	ENST00000497425	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TTC21B-208	ENST00000497425	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TTC21B-208	ENST00000497425	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TTC21B-208	ENST00000497425		A0A1W2PPH5	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	INPPL1	O15357	1258 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	RNF8	O76064	485 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SGPL1	O95470	568 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	PLAU	P00749	431 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	UROD	P06132	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	CAPN3	P20807	821 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	MTNR1A	P48039	350 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF81	P51508	661 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	CCR9	P51686	369 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	TUBA4A	P68366	448 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	TFF2	Q03403	129 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	AOX1	Q06278	1338 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	KRT32	Q14532	448 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	KAT2B	Q92831	832 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	PER2	O15055	1255 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	STRN	O43815	780 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	CBX6	O95503	412 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	NFATC1	O95644	943 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	F9	P00740	461 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	FCGR2A	P12318	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	MAN1A1	P33908	653 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	CASP2	P42575	452 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	HSPH1	Q92598	858 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425		Q9N2J8	555 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TTC21B-208	ENST00000497425	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms