RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, human

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLTC-208	ENST00000496076	PAX3	P23760	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	GABRB3	P28472	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	HNF4G	Q14541	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TAF5L	O75529	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TCEA3	O75764	348 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	CXCR3	P49682	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TUBA1B	P68363	451 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	PKP4	Q99569	1192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	IL25	Q9H293	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	POM121B	A6NF01	834 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076		J3KTA2	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076		M0QYT0	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	BMPR1B	O00238	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	KPNA5	O15131	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ASAP2	O43150	1006 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	NBN	O60934	754 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	NDST3	O95803	873 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	PEPD	P12955	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	KCNJ13	O60928	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	KLRC2	P26717	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	STAT1	P42224	750 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	AMT	P48728	403 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	PRIM2	P49643	509 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ADPRH	P54922	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TAS2R50	P59544	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TRIM14	Q14142	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	DPP10	Q8N608	796 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	NPHP1	O15259	732 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	SERPINB2	P05120	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	AVPR1A	P37288	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	HAL	P42357	657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	NUDT6	P53370	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	FOXL2	P58012	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	TLE3	Q04726	772 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLTC-208	ENST00000496076	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLTC-208	ENST00000496076	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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