RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494570.1

KDM4C-211, Transcript of lysine demethylase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4C, Length 647 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4C-211ENST00000494570 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SNAP91O60641 907 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SRGAP2O75044 1071 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SIN3BO75182 1162 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 LRIG2O94898 1065 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 CD160O95971 181 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ASLP04424 464 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 GLDCP23378 1020 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TPMTP51580 245 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 CA9Q16790 459 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SARM1Q6SZW1 724 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TMC6Q7Z403 805 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 DRC7Q8IY82 874 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PGBD3Q8N328 593 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 DEFB119Q8N690 84 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PTPRN2Q92932 1015 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 IQCDQ96DY2 449 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PEBP4Q96S96 227 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PARVAQ9NVD7 372 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 NCDNQ9UBB6 729 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 RAB23Q9ULC3 237 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 FZD10Q9ULW2 581 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SPEGQ15772 3267 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 CACNA1AO00555 2505 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ILVBLA1L0T0 632 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 K7ERQ8 282 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 LRP3O75074 770 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF217O75362 1048 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 WFS1O76024 890 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 RHOBTB1O94844 696 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 CYP1A2P05177 515 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF806P0C7X5 589 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TCF4P15884 667 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 IL1R2P27930 398 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 L1CAMP32004 1257 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 METAP1P53582 386 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 STARD3Q14849 445 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 CSRP2Q16527 193 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 LYPD8Q6UX82 237 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 LRRC31Q6UY01 552 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 C11orf74Q86VG3 221 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF511Q8NB15 262 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 OR7D4Q8NG98 312 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TCEAL3Q969E4 200 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 RMDN1Q96DB5 314 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 CHP1Q99653 195 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 THAP2Q9H0W7 228 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 SUN2Q9UH99 717 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 VPS51Q9UID3 782 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.42□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.066e-7■■□□□ 13.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms