RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ADSSL1Q8N142 457 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 GHDCQ8N2G8 530 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 AMER2Q8N7J2 671 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SETD9Q8NE22 299 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 HSPH1Q92598 858 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 RITA1Q96K30 269 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 FCRL5Q96RD9 977 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ASB6Q9NWX5 421 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 UPB1Q9UBR1 384 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087X1B8 175 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM22K7EJ46 135 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 RRHO14718 337 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TNFSF14O43557 240 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRC-212ENST00000491302 ACADMP11310 421 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 INSRRP14616 1297 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 EFNB1P98172 346 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRC-212ENST00000491302 MTA1Q13330 715 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 MAMLD1Q13495 774 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD2Q14681 263 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 NEK8Q86SG6 692 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CPXM2Q8N436 756 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SCAIQ8N9R8 606 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 NEUROD6Q96NK8 337 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ASB2Q96Q27 587 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SDF4Q9BRK5 362 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 USP44Q9H0E7 712 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 KLK15Q9H2R5 256 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 Q9N2J8 555 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 RAMP2O60895 175 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 GFPT2O94808 682 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PLK5Q496M5 336 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf22Q49AR2 442 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CHSY1Q86X52 802 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TICAM2Q86XR7 235 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 FRG2BQ96QU4 278 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 IFT27Q9BW83 186 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO40Q9UH90 709 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf100A8MU93 164 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CEP104O60308 925 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 FCGR2AP12318 317 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 LAMP2P13473 410 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TFEBP19484 476 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TACR2P21452 398 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KB1P23443 525 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNA5P30532 468 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRC-212ENST00000491302 ZNF398Q8TD17 642 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PEMTQ9UBM1 199 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 INSL6Q9Y581 213 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 B8ZZF3 427 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 INPPL1O15357 1258 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 NFATC1O95644 943 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 PLAUP00749 431 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CD63P08962 238 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-212ENST00000491302 ST6GAL1P15907 406 aa8.24□□□□□ -1.09
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