RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488687.5

PSME4-209, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene PSME4, Length 3,073 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-209ENST00000488687 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 VWA8A3KMH1 1905 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SLC12A8A0AV02 714 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TBX18O95935 607 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 NFKB1P19838 968 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CCNCP24863 283 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CRADDP78560 199 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.45e-7■■■■□ 26.5
PSME4-209ENST00000488687 PTPRNQ16849 979 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZNF534Q76KX8 674 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 NAT9Q9BTE0 207 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GBA3Q9H227 469 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 COMMD8Q9NX08 183 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 BFARQ9NZS9 450 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MPP6Q9NZW5 540 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 HRO43593 1189 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 KRT38O76015 456 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZWINTO95229 277 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 AP2A1O95782 977 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 POLBP06746 335 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CLTBP09497 229 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CCNB1P14635 433 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 JUNDP17535 347 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PGAM1P18669 254 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 DRD4P21917 467 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MAGEA3P43357 314 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZBTB17Q13105 803 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MPP2Q14168 576 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TMEM169Q96HH4 297 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 C1orf74Q96LT6 269 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MAGEB18Q96M61 343 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 UBP1Q9NZI7 540 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PSMD3O43242 534 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TLR5O60602 858 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 LPXNO60711 386 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 USP12O75317 370 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 FAM155BO75949 473 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CA8P35219 290 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 RFC2P35250 354 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZNF33AQ06730 810 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 IFT88Q13099 833 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 RASIP1Q5U651 963 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 C14orf80Q86SX3 495 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MARVELD3Q96A59 401 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 IGSF21Q96ID5 467 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TEKT5Q96M29 485 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZNF558Q96NG5 402 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms