RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 WASH4PA8MWX3 477 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ATP9BO43861 1147 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 BNIP3LO60238 219 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 LCA5LO95447 670 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 CD48P09326 243 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ERCC2P18074 760 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 AMPD1P23109 780 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MAPKAPK2P49137 400 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 METAP1P53582 386 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 KRT83P78385 493 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SULT2A1Q06520 285 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MMRN1Q13201 1228 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 DLG2Q15700 870 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 CCDC6Q16204 474 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 RFX8Q6ZV50 586 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 Q6ZVU0 165 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 FAM124AQ86V42 546 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 TMEFF1Q8IYR6 380 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SH2D3CQ8N5H7 860 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ATP11CQ8NB49 1132 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 KDM1BQ8NB78 822 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 HMCESQ96FZ2 354 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ITM2CQ9NQX7 267 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 KLHL11Q9NVR0 708 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A13Q9UJS0 675 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MYO15AQ9UKN7 3530 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 NUMA1Q14980 2115 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 GPR179Q6PRD1 2367 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 A0A0U1RQJ8 604 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 RAMP2O60895 175 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 NDUFA10O95299 355 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 NNMTP40261 264 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 TPMTP51580 245 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 DPYSQ14117 519 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 E2F5Q15329 346 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 DPYSL2Q16555 572 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 BOLA3Q53S33 107 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ARMCX6Q7L4S7 300 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 POLNQ7Z5Q5 900 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 TMTC1Q8IUR5 882 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 CCDC170Q8IYT3 715 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 NPWQ8N729 165 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ACRBPQ8NEB7 543 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 RFFLQ8WZ73 363 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 PPP1R9BQ96SB3 815 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SLC39A8Q9C0K1 460 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MAGEH1Q9H213 219 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 TNKS2Q9H2K2 1166 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 GOLPH3Q9H4A6 298 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SMOC1Q9H4F8 434 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 LRRC19Q9H756 370 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 PCDH18Q9HCL0 1135 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ETNK2Q9NVF9 386 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SERGEFQ9UGK8 458 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SALL4Q9UJQ4 1053 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SARDHQ9UL12 918 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 RAB23Q9ULC3 237 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 INTUQ9ULD6 942 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 HS3ST2Q9Y278 367 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 DMDP11532 3685 aa12.4□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 VPS13AQ96RL7 3174 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RASA4BC9J798 803 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PLK4O00444 970 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 MID1O15344 667 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 MAP3K13O43283 966 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 DAPK3O43293 454 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RASA4O43374 803 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 MTA2O94776 668 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 IL4RP24394 825 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PTGER3P43115 390 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ARSEP51690 589 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 POM121L1PQ3SYA9 428 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PMS2CLQ68D20 193 aa12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms