RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 NLRP14Q86W24 1093 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 PLD5Q8N7P1 536 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 CEP112Q8N8E3 955 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC89Q8N998 374 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 ASIC4Q96FT7 647 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 IER2Q9BTL4 223 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 SUN2Q9UH99 717 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 FBXO10Q9UK96 956 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.96□□□□□ -0.81
CTPS1-210ENST00000486889 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 I6L893 689 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 GFRA2O00451 464 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 GAS8O95995 478 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 DLDP09622 509 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 IL4RP24394 825 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 HLA-FP30511 346 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CHRNA3P32297 505 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 MARCKSL1P49006 195 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 GALK1P51570 392 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 GALNT2Q10471 571 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 LMAN2Q12907 356 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 PRPSAP1Q14558 356 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CCNG2Q16589 344 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 MARC1Q5VT66 337 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 RNF43Q68DV7 783 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SIX5Q8N196 739 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 FATE1Q969F0 183 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 TTC17Q96AE7 1141 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 HDAC11Q96DB2 347 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 TSGA13Q96PP4 275 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CEP44Q9C0F1 390 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC19Q9H756 370 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 FBRSQ9HAH7 460 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SEPT3Q9UH03 358 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CDC23Q9UJX2 597 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CA14Q9ULX7 337 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 A0A0A0MRY4 1105 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SGK1O00141 431 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 MATN3O15232 486 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 GPR37L1O60883 481 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 RBP3P10745 1247 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CD70P32970 193 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SGSHP51688 502 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 STARD6P59095 220 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ZXDAP98168 799 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ITKQ08881 620 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 NOMO1Q15155 1222 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 PON2Q15165 354 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 EOGTQ5NDL2 527 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 POTEHQ6S545 545 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-210ENST00000486889 CHPFQ8IZ52 775 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms