RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	LGI2	Q8N0V4	545 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	FIBCD1	Q8N539	461 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	FCRL5	Q96RD9	977 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	PTPRS	Q13332	1948 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	COCH	O43405	550 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	FGB	P02675	491 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC18A1	P54219	525 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	GEM	P55040	296 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	PLD4	Q96BZ4	506 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	HMCES	Q96FZ2	354 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	RAMP2	O60895	175 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	C1QA	P02745	245 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	PPP3CC	P48454	512 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	CDH17	Q12864	832 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	CRYM	Q14894	314 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MZB1	Q8WU39	189 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	TTC17	Q96AE7	1141 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	APOL2	Q9BQE5	337 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MAFF	Q9ULX9	164 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	CACNG3	O60359	315 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM155B	O75949	473 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	KRT38	O76015	456 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	FGF18	O76093	207 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	OR1E1	P30953	314 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MAPKAPK2	P49137	400 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SERPINB9	P50453	376 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	RENBP	P51606	427 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ALDH1A2	O94788	518 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	HLA-DQB2	P05538	268 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	DRD4	P21917	467 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ITIH5	Q86UX2	942 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	GPR65	Q8IYL9	337 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MAGEB16	A2A368	324 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	GOLGA8R	I6L899	631 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP9B	O43861	1147 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ZWINT	O95229	277 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	PARP15	Q460N3	678 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	HHAT	Q5VTY9	493 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	IPMK	Q8NFU5	416 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	IL22	Q9GZX6	179 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	TEX28	O15482	410 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	TYROBP	O43914	113 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	C1QTNF8	P60827	252 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ITK	Q08881	620 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	NAB1	Q13506	487 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MARC1	Q5VT66	337 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	RASSF3	Q86WH2	238 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	DENND1C	Q8IV53	801 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	FATE1	Q969F0	183 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MTBP	Q96DY7	904 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MAGEB18	Q96M61	343 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230		J3KR12	359 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	IRF1	P10914	325 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MGAT5	Q09328	741 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	18.65	■□□□□ 0.58

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