RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471215.1

BUD23-215, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, human

TSL 2

Gene BUD23, Length 3,886 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BUD23-215	ENST00000471215	BRCC3	P46736	316 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PGGT1B	P53609	377 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	LINC00523	Q86TU6	105 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	NPW	Q8N729	165 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ZNF333	Q96JL9	665 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	FICD	Q9BVA6	458 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	DONSON	Q9NYP3	566 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	CAPN14	A8MX76	684 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	USP1	O94782	785 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ODC1	P11926	461 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	NAGLU	P54802	743 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TSPY1	Q01534	308 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	CTBP1	Q13363	440 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ANO7	Q6IWH7	933 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	VAT1	Q99536	393 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	GBA3	Q9H227	469 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	LRPAP1	P30533	357 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ABL2	P42684	1182 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	NUMB	P49757	651 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	AIF1	P55008	147 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	GRM3	Q14832	879 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	DBN1	Q16643	649 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	NTAN1	Q96AB6	310 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PANX3	Q96QZ0	392 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PSMD3	O43242	534 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	THPO	P40225	353 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	RAP1GDS1	P52306	607 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	CACNA2D1	P54289	1103 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ANO4	Q32M45	955 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TAC4	Q86UU9	113 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79	2e-6	■□□□□ 11.1
BUD23-215	ENST00000471215	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ANK1	P16157	1881 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	AP3B1	O00203	1094 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PIGN	O95427	931 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	FYN	P06241	537 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ART3	Q13508	389 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TEKT5	Q96M29	485 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	GBP5	Q96PP8	586 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PTPN18	Q99952	460 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	NUF2	Q9BZD4	464 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	MIOS	Q9NXC5	875 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	MGAM	O43451	1857 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	PTPRF	P10586	1907 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	DPPA5	A6NC42	116 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ARL5C	A6NH57	179 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BUD23-215	ENST00000471215	ENO4	A6NNW6	628 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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