RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE4BO95155 1302 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 E7ESA3 106 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 AVILO75366 819 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RFPL1O75677 317 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ETFBP38117 255 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC1A6P48664 564 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NRLP54845 237 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF10Q13118 480 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRYD7Q5W111 196 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC29A1Q99808 456 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf49Q9H741 205 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 AP4S1Q9Y587 144 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNB1P11230 501 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MASP1P48740 699 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SELENBP1Q13228 472 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CEACAM7Q14002 265 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB39AQ14964 217 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 OXA1LQ15070 435 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PGS1Q32NB8 556 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MROH9Q5TGP6 573 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 LBX2Q6XYB7 198 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DSELQ8IZU8 1212 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TNS4Q8IZW8 715 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 UBR7Q8N806 425 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ACDQ96AP0 544 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FIZ1Q96SL8 496 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CIB1Q99828 191 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RTKNQ9BST9 563 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 IPPQ9Y573 584 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRT4C9JH25 899 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 KCNH1O95259 989 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 GNAO1P09471 354 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 PSMC5P62195 406 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 CARTPTQ16568 116 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 UTS2BQ765I0 119 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TPH2Q8IWU9 490 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 LENG9Q96B70 501 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MLLT10P55197 1068 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NFATC3Q12968 1075 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF6Q15052 776 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NEDD8Q15843 81 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.55□□□□□ -1.04
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