RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 IL1RL2Q9HB29 575 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PALMDQ9NP74 551 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM216Q9P0N5 145 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 MGEA5O60502 916 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 CPA3P15088 417 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC1A6P48664 564 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SCNN1BP51168 640 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF180Q86T96 592 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 NDEL1Q9GZM8 345 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PLA2G4CQ9UP65 541 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 DOCK1Q14185 1865 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TM9SF1O15321 606 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 GPC4O75487 556 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SPAG6O75602 509 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 AMHP03971 560 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPN3P26045 913 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 NAGLUP54802 743 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF235Q14590 738 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 CRYBG2Q8N1P7 616 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 NUF2Q9BZD4 464 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 WWP1Q9H0M0 922 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD12Q6UB98 2062 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 DAB1O75553 588 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 CCNB1P14635 433 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 CCR1P32246 355 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 MMEL1Q495T6 779 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SCLYQ96I15 445 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.27e-6■■□□□ 13
RABGEF1-210ENST00000437078 FTHL17Q9BXU8 183 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 STARD13Q9Y3M8 1113 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 CD86P42081 329 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPN9P43378 593 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 NR2C2P49116 596 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP8P85298 464 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PLIN5Q00G26 463 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPRCAPQ14761 206 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 CLNKQ7Z7G1 428 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10T2Q8NGX3 314 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 ANLNQ9NQW6 1124 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 BNIP1Q12981 228 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 DUSP4Q13115 394 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC44A4Q53GD3 710 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP17Q68EM7 881 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TOP6BLQ8N6T0 577 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SIGLEC10Q96LC7 697 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SNX15Q9NRS6 342 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 GMIPQ9P107 970 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TK2O00142 265 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TYROBPO43914 113 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT36O76013 467 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TUFMP49411 452 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 ENPEPQ07075 957 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PARP6Q2NL67 630 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 STRADAQ7RTN6 431 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TEKT4Q8WW24 435 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 CASP10Q92851 521 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 KATNBL1Q9H079 304 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 SDK1Q7Z5N4 2213 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 OR51F1A6NGY5 319 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC22O60826 627 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PGAM1P18669 254 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX9Q8N6V9 391 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 TRPV1Q8NER1 839 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PLLPQ9Y342 182 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 NEMP2A6NFY4 417 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-210ENST00000437078 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.81□□□□□ -0.25e-6■□□□□ 8.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms