RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418646.5

GPCPD1-202, Transcript of glycerophosphocholine phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 5

Gene GPCPD1, Length 4,015 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1-202ENST00000418646 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.56□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 DPP3Q9NY33 737 aa4.56□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PIM2Q9P1W9 311 aa4.56□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 SERTM1A2A2V5 107 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 NCAM2O15394 837 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 MAFKO60675 156 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 GJB1P08034 283 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PAX3P23760 479 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 GP5P40197 560 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 DAOAP59103 153 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 OVGP1Q12889 678 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 KLF10Q13118 480 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 SETDB1Q15047 1291 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TAF11Q15544 211 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 ZNF667Q5HYK9 610 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 FAM26DQ5JW98 314 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 OGFOD2Q6N063 350 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 RNF149Q8NC42 400 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TSPEARQ8WU66 669 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CHAC2Q8WUX2 184 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 SGF29Q96ES7 293 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TEKT5Q96M29 485 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PIGVQ9NUD9 493 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 ERAP1Q9NZ08 941 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CCL27Q9Y4X3 112 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 MAGEB16A2A368 324 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 DYTNA2CJ06 578 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 C7orf72A4D263 438 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 ANKRD28O15084 1053 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TBC1D4O60343 1298 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 KRT37O76014 449 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 BMP10O95393 424 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 HSD17B1P14061 328 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 IL1RNP18510 177 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 RPS6KA3P51812 740 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CACNA2D1P54289 1103 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 AQP4P55087 323 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 RBP5P82980 135 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CDKL1Q00532 357 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 GRIK2Q13002 908 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 RCN2Q14257 317 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 KCTD2Q14681 263 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 KIZQ2M2Z5 673 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 FYB2Q5VWT5 728 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 ZFP1Q6P2D0 407 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CCDC25Q86WR0 208 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 RIMKLAQ8IXN7 391 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PACRGLQ8N7B6 248 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 C12orf29Q8N999 325 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PPP1R14BQ96C90 147 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 FCRL1Q96LA6 429 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CRTAC1Q9NQ79 661 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 SNTG2Q9NY99 539 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 RRN3Q9NYV6 651 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 RAP2CQ9Y3L5 183 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 H0YHG0 523 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 ASLP04424 464 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 COX4I1P13073 169 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 MTHFD2P13995 350 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 VCLP18206 1134 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 GPX3P22352 226 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 AQP5P55064 265 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 E2F2Q14209 437 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CHI3L2Q15782 390 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 CRY1Q16526 586 aa4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GPCPD1-202ENST00000418646 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms