RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 BANPQ8N9N5 519 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM227BQ96M60 508 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MEIS3Q99687 375 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 RSAD1Q9HA92 442 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 EMSYQ7Z589 1322 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0X1KG70 313 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 LCHNA4D1U4 455 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SNAP23O00161 211 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 LAD1O00515 517 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 BET1O15155 118 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 BMP1P13497 986 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 FECHP22830 423 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC7A2P52569 658 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ERVK-8P63133 956 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SQSTM1Q13501 440 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRRQ15256 657 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ARSKQ6UWY0 536 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CD101Q93033 1021 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PSME2Q9UL46 239 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 JAK2O60674 1132 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ENTPD5O75356 428 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ENDOD1O94919 500 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PRAMEF12O95522 483 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TNNI1P19237 187 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP2A7P20853 494 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKCQQ04759 706 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC14A1Q13336 389 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 GRM3Q14832 879 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CHRNA2Q15822 529 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 STXBP2Q15833 593 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 Q5PR19 223 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf88Q6PI97 169 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 APOA5Q6Q788 366 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TEKT5Q96M29 485 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MYH1P12882 1939 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR37O15354 613 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 OPHN1O60890 802 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 WFS1O76024 890 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 FABP1P07148 127 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP21A2P08686 494 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGEF1-202ENST00000380828 STMN1P16949 149 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MX2P20592 715 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGEF1-202ENST00000380828 WNT5AP41221 380 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PAFAH1B1P43034 410 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGEF1-202ENST00000380828 AKR1D1P51857 326 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZP2Q05996 745 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGEF1-202ENST00000380828 PMS2P3Q13401 168 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ITGA9Q13797 1035 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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