RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 MTA1Q13330 715 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DPYSL3Q14195 570 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GRB14Q14449 540 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SFT2D3Q587I9 215 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GPR142Q7Z601 462 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DPP9Q86TI2 863 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CDKL2Q92772 493 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SERAC1Q96JX3 654 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 VTA1Q9NP79 307 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ACP6Q9NPH0 428 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 VPS45Q9NRW7 570 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 POMPQ9Y244 141 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 WDR81Q562E7 1941 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MED7O43513 233 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CST8O60676 142 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SIN3BO75182 1162 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DRAP01903 254 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINE1P05121 402 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TFAP2AP05549 437 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PGK2P07205 417 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PDGFRBP09619 1106 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM18P0DKX4 95 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 THRAP10827 490 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ETS1P14921 441 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ETS2P15036 469 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TNNI1P19237 187 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PROZP22891 400 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PEX2P28328 305 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 L1CAMP32004 1257 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEA6P43360 314 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CD97P48960 835 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ESRRGP62508 458 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PDE1BQ01064 536 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH1Q08174 1060 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DLG1Q12959 904 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CCNIQ14094 377 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DPYSQ14117 519 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TTLL4Q14679 1199 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.233e-6■□□□□ 10.7
CTPS1-201ENST00000372616 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 C17orf99Q6UX52 265 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 METTL7BQ6UX53 244 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PACS1Q6VY07 963 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MCUQ8NE86 351 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RIN3Q8TB24 985 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FNDC8Q8TC99 324 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GAB3Q8WWW8 586 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 USP29Q9HBJ7 922 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MID2Q9UJV3 735 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 E9PBE3 544 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PI4K2BG5E9Z4 385 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CA12O43570 354 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PEX10O60683 326 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 APOEP02649 317 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CD48P09326 243 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CDK4P11802 303 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF23P17027 643 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MX2P20592 715 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NME2P22392 152 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NPTX2P47972 431 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms