RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 ENO1P06733 434 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 TPH1P17752 444 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 TYMPP19971 482 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 PAX3P23760 479 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 GRK2P25098 689 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 YY1P25490 414 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCG1P45844 678 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CDH17Q12864 832 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 MPP3Q13368 585 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC153Q494R4 210 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 KIFC1Q9BW19 673 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CCNCP24863 283 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 DLG2Q15700 870 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNA10Q16322 511 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 SCD5Q86SK9 330 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ACVR1CQ8NER5 493 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 USP33Q8TEY7 942 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CASP10Q92851 521 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 IL12RB2Q99665 862 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF195O14628 629 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 PAGE1O75459 146 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 FLT3LGP49771 235 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 IRF9Q00978 393 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 TSPY1Q01534 308 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 TBCCQ15814 346 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 SIK2Q9H0K1 926 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 TAGLN3Q9UI15 199 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 DFFAO00273 331 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 MAFKO60675 156 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 ELF1P32519 619 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 HTR7P34969 479 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP8P85298 464 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 PRPSAP1Q14558 356 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM26DQ5JW98 314 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 MCUR1Q96AQ8 359 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 VPS39Q96JC1 886 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A096LPK6 155 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 G3V2L1 256 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMD3O43242 534 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 TIMM44O43615 452 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 MPOP05164 745 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 RALBP11234 206 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 CPA3P15088 417 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 AOC1P19801 751 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJB2P25686 324 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 CDK7P50613 346 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 FCGRTP55899 365 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 ITGA9Q13797 1035 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 URGCPQ8TCY9 931 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR60Q8WVS4 1066 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 FCRL5Q96RD9 977 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 PNPOQ9NVS9 261 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 B2RBV5 119 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 AP3B1O00203 1094 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 C2P06681 752 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 RAP1GDS1P52306 607 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 RCN2Q14257 317 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 AFMIDQ63HM1 303 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00523Q86TU6 105 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 GIMAP7Q8NHV1 300 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 RILPQ96NA2 401 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR22Q99680 433 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 DCLRE1BQ9H816 532 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 YY1AP1Q9H869 796 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-202ENST00000335475 NMUR1Q9HB89 426 aa21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms