RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SNX17Q15036 470 aa16.89■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 BOLA3Q53S33 107 aa16.89■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.89■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 RAB2BQ8WUD1 216 aa16.89■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SEPT8Q92599 483 aa16.89■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.89■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.89■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CHST12Q9NRB3 414 aa16.89■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 MT-ND1P03886 318 aa16.88■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 HOXD13P35453 343 aa16.88■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.88■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.88■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 FGFR1P11362 822 aa16.88■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.88■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ACOT9Q9Y305 439 aa16.88■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PTGER2P43116 358 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 NAMPTP43490 491 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 DMC1Q14565 340 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 FGD3Q5JSP0 725 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SLC15A4Q8N697 577 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 DMRTB1Q96MA1 342 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ZNF536O15090 1300 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CSH1P0DML2 217 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CSH2P0DML3 217 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 NPR1P16066 1061 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CDKN2BP42772 138 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 TMEM198Q66K66 360 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SLC22A16Q86VW1 577 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SEMA3DO95025 777 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SOX10P56693 466 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SURF1Q15526 300 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 WDR70Q9NW82 654 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SERPINB7O75635 380 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SLC4A1P02730 911 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 MERTKQ12866 999 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 GTF2H3Q13889 308 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 FAR2Q96K12 515 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB18Q99592 522 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 MAFGO15525 162 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TNFRSF21O75509 655 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PAMP19021 973 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 KBTBD6Q86V97 674 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TMEM143Q96AN5 459 aa16.86■□□□□ 0.29
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