RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 TUBBP07437 444 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 RHOCP08134 193 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ADH5P11766 374 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 TYRP14679 529 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ATP5OP48047 213 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 TERF1P54274 439 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 PTK6Q13882 451 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 C8orf74Q6P047 294 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 MFN1Q8IWA4 741 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 YAF2Q8IY57 180 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 CPA6Q8N4T0 437 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 SEC14L1Q92503 715 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ACDQ96AP0 544 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ALG14Q96F25 216 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 P2RY11Q96G91 374 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ECT2Q9H8V3 914 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 PDFQ9HBH1 243 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 HPS4Q9NQG7 708 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 RAD51CO43502 376 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 PRAMEF11O60813 436 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 RBL1P28749 1068 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 SLC20A2Q08357 652 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 CDH18Q13634 790 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 RUNX3Q13761 415 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ANO4Q32M45 955 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 JAMLQ86YT9 394 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 TEX26Q8N6G2 289 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC89Q8N998 374 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 ASIC4Q96FT7 647 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 HMCESQ96FZ2 354 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 IL12RB2Q99665 862 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 BBS2Q9BXC9 721 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 RAB17Q9H0T7 212 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 KLF15Q9UIH9 416 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-202ENST00000317118 REV3LO60673 3130 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 DFFAO00273 331 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZMPSTE24O75844 475 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PEX11BO96011 259 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CISD3P0C7P0 127 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 VAV1P15498 845 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 KCNJ1P48048 391 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RENBPP51606 427 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SULT2A1Q06520 285 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 AP1B1Q10567 949 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 WASHC5Q12768 1159 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SNX1Q13596 522 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GAB4Q2WGN9 574 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 FSCBQ5H9T9 825 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
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