RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 GPAMQ9HCL2 828 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 NR2C2P49116 596 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 LGSNQ5TDP6 509 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 ARCQ7LC44 396 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 CCDC185Q8N715 623 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 CEP41Q9BYV8 373 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 SNX25Q9H3E2 840 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HPS6-201ENST00000299238 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CLCN2P51788 898 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 ADAM17P78536 824 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CHI3L2Q15782 390 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 DTLQ9NZJ0 730 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 TRIM17Q9Y577 477 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 USP3Q9Y6I4 520 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 TREHO43280 583 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 SCNN1AP37088 669 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 PSEN2P49810 448 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CD300CQ08708 224 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 SEMA5AQ13591 1074 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 UBXN11Q5T124 520 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CPA4Q9UI42 421 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CAPN14A8MX76 684 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 FKBP6O75344 327 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 KRT38O76015 456 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 FKBP1BP68106 108 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 SMUG1Q53HV7 270 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 C7orf26Q96N11 449 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 TOMM70O94826 608 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 KCNE1P15382 129 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 PNPLA4P41247 253 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 TAF6P49848 677 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 MYBPC1Q00872 1141 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 APPL2Q8NEU8 664 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 A0A088AWK7 358 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP10A1A4S6 786 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 TEX44Q53QW1 395 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 XKR4Q5GH76 650 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 MORN1Q5T089 497 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 FAM91A1Q658Y4 838 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 PACS1Q6VY07 963 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 C14orf80Q86SX3 495 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 ICA1LQ8NDH6 482 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CNBD2Q96M20 576 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 FUOMA2VDF0 154 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 DGKIO75912 1065 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 SLC25A3Q00325 362 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 MAP2K5Q13163 448 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 E2F7Q96AV8 911 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CROTQ9UKG9 612 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 AK5Q9Y6K8 562 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 I3L4J1 428 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 HAS3O00219 553 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 MYL3P08590 195 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 GOT1P17174 413 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 FDFT1P37268 417 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS6-201ENST00000299238 CCNIQ14094 377 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms