RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 GMPRP36959 345 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MPP3Q13368 585 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CCDC153Q494R4 210 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MANEALQ5VSG8 457 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 LZTR1Q8N653 840 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 RILPQ96NA2 401 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF358Q9NW07 568 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 SQORQ9Y6N5 450 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CAPN14A8MX76 684 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 B4GALT3O60512 393 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 PEX11AO75192 247 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ELNP15502 786 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 GM2AP17900 193 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 NMBRP28336 390 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 PPP2R5DQ14738 602 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 NMUR1Q9HB89 426 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MCM8Q9UJA3 840 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TIMM44O43615 452 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MAFKO60675 156 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MPOP05164 745 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ABCG1P45844 678 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF778Q96MU6 729 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 IL12RB2Q99665 862 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 EBF4Q9BQW3 602 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 KIFC1Q9BW19 673 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 RGS18Q9NS28 235 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 A0A096LPK6 155 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 DDHD2O94830 711 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 RALBP11234 206 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CPA3P15088 417 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TREML1Q86YW5 311 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 FCRL5Q96RD9 977 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 GLOD4Q9HC38 313 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 A0A1W2PQH9 124 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MATN3O15232 486 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ANXA9O76027 345 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ENO1P06733 434 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CDK7P50613 346 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 URGCPQ8TCY9 931 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CENPFP49454 3210 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 SERPINA6P08185 405 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TUBP50607 506 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TEX9Q8N6V9 391 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 IPMKQ8NFU5 416 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 VPS39Q96JC1 886 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CCDC78A2IDD5 438 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ENTPD5O75356 428 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 EOMESO95936 686 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 DSC1Q08554 894 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ITGA9Q13797 1035 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 DLG2Q15700 870 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TBCCQ15814 346 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 PCID2Q5JVF3 399 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 ARTNQ5T4W7 220 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 CLEC14AQ86T13 490 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 TTC8Q8TAM2 541 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL16-201ENST00000293778 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms