RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF605Q86T29 641 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 C3orf18Q9UK00 162 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 F5H5T6 163 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 KLRC4O43908 158 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 KCNH1O95259 989 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 MYL12AP19105 171 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 SLC9A5Q14940 896 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SPATA20Q8TB22 786 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 AGPSO00116 658 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 PFKFB4Q16877 469 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 TEKT5Q96M29 485 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 EHD3Q9NZN3 535 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 KIF1AQ12756 1690 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 OR1E1P30953 314 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 ARMC3Q5W041 872 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 CIB1Q99828 191 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 ASTN1O14525 1302 aa6.44□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 TSPAN8P19075 237 aa6.43□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 ARHGEF6Q15052 776 aa6.43□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 MICALL2Q8IY33 904 aa6.43□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 POLLQ9UGP5 575 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 THP07101 528 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SERPINF2P08697 491 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 TNK2Q07912 1038 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 FGD3Q5JSP0 725 aa6.43□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.43□□□□□ -1.38
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