RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 FAM161BQ96MY7 647 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 NPY6RQ99463 290 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 DNAI2Q9GZS0 605 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 TLR5O60602 858 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 ADAMTS4O75173 837 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 ASMTLO95671 621 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 HSPA4LO95757 839 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 CDH13P55290 713 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 TBX4P57082 545 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 ADAM17P78536 824 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 DPYSL2Q16555 572 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 KYAT1Q16773 422 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 CNTD1Q8N815 330 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 CCT6BQ92526 530 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 HMCESQ96FZ2 354 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 THTPAQ9BU02 230 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 IL1RL2Q9HB29 575 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.28□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 HAS3O00219 553 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 POLBP06746 335 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 CHRNGP07510 517 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 GABRB2P47870 512 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 NAGLUP54802 743 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 LGSNQ5TDP6 509 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 MAGEB18Q96M61 343 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 TLK1Q9UKI8 766 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 PARP14Q460N5 1801 aa9.27□□□□□ -0.92
CKAP2-201ENST00000258607 A0A096LPK6 155 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 SH3BGRLO75368 114 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 KCNE1P15382 129 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 CTPS1P17812 591 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 SLC11A1P49279 550 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 VEGFBP49765 207 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 PRAMEP78395 509 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 TLE2Q04725 743 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM198Q66K66 360 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 SPRED2Q7Z698 418 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 PIM3Q86V86 326 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 KCNMB4Q86W47 210 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 NUF2Q9BZD4 464 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 MUC3BQ9H195 1237 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 HIPK3Q9H422 1215 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 SRRDQ9UH36 339 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 COL6A3P12111 3177 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 GYG2O15488 501 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 HAUS5O94927 633 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 NOGQ13253 232 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 STX3Q13277 289 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 PIF1Q9H611 641 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 CDH9Q9ULB4 789 aa9.27□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 NBNO60934 754 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 HLA-DQB2P05538 268 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 CKMP06732 381 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 ITGA2BP08514 1039 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 EPHA3P29320 983 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 NCALDP61601 193 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF235Q14590 738 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 GRM3Q14832 879 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 NAA25Q14CX7 972 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 SNCBQ16143 134 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 RASIP1Q5U651 963 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF534Q76KX8 674 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 IGSF8Q969P0 613 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 CERS2Q96G23 380 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 SGSM3Q96HU1 749 aa9.26□□□□□ -0.93
CKAP2-201ENST00000258607 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms