RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ARSEP51690 589 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R40P59535 323 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 KRT83P78385 493 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ARF5P84085 180 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 LPAL2Q16609 132 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 PLK5Q496M5 336 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 FAM71BQ8TC56 605 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 TEKT4Q8WW24 435 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 RFFLQ8WZ73 363 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SPON2Q9BUD6 331 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 MAGEH1Q9H213 219 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ACTL7AQ9Y615 435 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 RCCD1A6NED2 376 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 NDUFA10O95299 355 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 IL4RP24394 825 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 TPI1P60174 286 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 RPS14P62263 151 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 DPYSQ14117 519 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 DLG2Q15700 870 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 LINGO4Q6UY18 593 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 RFX8Q6ZV50 586 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SIPA1Q96FS4 1042 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ERCC2P18074 760 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 MAN1A1P33908 653 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CEP68Q76N32 757 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 TSC1Q92574 1164 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 HSPH1Q92598 858 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 LRRC19Q9H756 370 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.8■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 FAM186AA6NE01 2351 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CBX4O00257 560 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 RAMP2O60895 175 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-19P01714 112 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 NNMTP40261 264 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP25P42331 645 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 MESDQ14696 234 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 AFMIDQ63HM1 303 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 STK40Q8N2I9 435 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 FBRSQ9HAH7 460 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 THADAQ6YHU6 1953 aa22.79■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ZNF292O60281 2723 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 RASA4BC9J798 803 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 RASA4O43374 803 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 KDELR3O43731 214 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 GFRA3O60609 400 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ZNF217O75362 1048 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CD48P09326 243 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 TPMTP51580 245 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SLC20A2Q08357 652 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 NUMA1Q14980 2115 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 IL31Q6EBC2 164 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CACUL1Q86Y37 369 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 HMCESQ96FZ2 354 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.78■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 AMPD1P23109 780 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ETFBP38117 255 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SPA17Q15506 151 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 PMS2CLQ68D20 193 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZVU0 165 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms