RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lsmem1Q3UQS2 128 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmtc1Q3UV71 942 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tlr11Q6R5P0 926 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rmi1Q9D4G9 616 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam217aQ9D9W6 419 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tsga13Q9DA17 273 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyth1Q9QX11 398 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ralgapa1Q6GYP7 2035 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 A0A286YCD0 109 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam83cA2ARK0 776 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lipo2D3YY49 398 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 LipiF6YQT7 476 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ap3d1O54774 1199 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Soat2O88908 525 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prdx3P20108 257 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arf5P84084 180 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Npy2rP97295 381 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sim2Q61079 657 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 HrQ61645 1182 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NovQ64299 354 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Glra2Q7TNC8 452 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Frs2Q8C180 508 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atg14Q8CDJ3 492 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gatad2aQ8CHY6 629 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TmieQ8K467 153 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Apbb3Q8R1C9 486 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgef3Q91X46 524 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PyglQ9ET01 850 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ankrd2Q9WV06 328 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Crybg1A0A0G2JG52 2065 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tap1P21958 724 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PnpP23492 289 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Neurog2P70447 263 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CtscP97821 462 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Emc10Q3TAS6 258 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp607aQ3TQG9 686 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Naaladl1Q7M758 745 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf775Q8BI73 538 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Proser2Q8C5R2 471 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atpaf2Q91YY4 289 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gprc5bQ923Z0 410 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrrc57Q9D1G5 239 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Capn12Q9ER56 720 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TomtA1Y9I9 258 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 F6Y6L6 278 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nthl1O35980 300 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adcy1O88444 1118 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fcgr2P08101 330 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdh1P09803 884 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd300lgQ1ERP8 331 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem184cQ3TPR7 525 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgef15Q5FWH6 849 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf185Q62394 352 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fcrl5Q68SN8 596 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp719Q8BIV1 735 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem74Q8BQU7 305 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Parp9Q8CAS9 866 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Caap1Q8VDY9 356 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Phf14Q9D4H9 881 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Elovl2Q9JLJ4 292 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp11cQ9QZW0 1129 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tcte1A6H639 498 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ism2D3Z6A3 493 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm2030D3Z7C4 212 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm6205E9PZS2 359 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Per2O54943 1257 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Runx2Q08775 607 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Armc7Q3UJZ3 198 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lamb3Q61087 1168 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc13a4Q8BZ82 625 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm6367Q8C6L9 287 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sh2d5Q8JZW5 429 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MfrpQ8K480 584 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbxw7Q8VBV4 629 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eps8l2Q99K30 729 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdkn2aipnlQ9D211 116 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Exoc2Q9D4H1 924 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam227bQ9D518 532 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MkksQ9JI70 570 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tdrd6P61407 2134 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nek2O35942 443 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Htr7P32304 448 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gdf5P43027 495 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arl4aP61213 200 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rps14P62264 151 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 IqcmQ149I8 489 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sap25Q1EHW4 186 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nhej1Q3KNJ2 295 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CtrcQ3SYP2 268 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Qsox2Q3TMX7 692 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc38a5Q3U1J0 479 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.4 ms