RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Clec12aQ504P2 267 aa15.56■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ssh3Q8K330 649 aa15.56■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Msh4Q99MT2 958 aa15.56■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Exo5Q9CXP9 373 aa15.56■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm7275E9Q1B3 247 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Otol1Q4ZJM7 482 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnf145Q5SWK7 663 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tgoln2Q62314 363 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc15a5Q8CBB2 566 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GabreA2AMW3 916 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cd40lgP27548 260 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp78Q5U406 512 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 EbplQ9D0P0 206 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prl2c5Q9JLV9 222 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm43518A0A0G2JGB6 165 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CflarO35732 481 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 JundP15066 341 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 RelaQ04207 549 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Usp39Q3TIX9 564 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ca4Q64444 305 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q80WR5 230 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zdhhc19Q810M5 347 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Asb11Q9CQ31 323 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AvenQ9D9K3 342 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mrpl46Q9EQI8 283 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 DgkeQ9R1C6 564 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arhgef10Q8C033 1345 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zc3h12bG3X9I7 835 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm12794L7MTS5 483 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hps1O08983 704 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nfkb1P25799 971 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Klra3Q64329 266 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Podnl1Q6P3Y9 559 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Iqcf4Q6P8Y2 204 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Enpp4Q8BTJ4 456 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kctd15Q8K0E1 283 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1502Q8VG66 316 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Abca14E9Q8F8 1683 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm7145A0A087WS64 360 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm4302E9PX25 294 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm5407E9Q7Q1 248 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hs3st1O35310 311 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sox6P40645 827 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dpf3P58269 378 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zbtb14Q08376 449 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfml2bQ3V1G4 746 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Elmo1Q8BPU7 727 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pou5f2Q9DAC9 329 aa15.55■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CremP27699 357 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bmp1P98063 991 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Parp6Q6P6P7 630 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GnasQ6R0H7 1133 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rxfp1Q6R6I7 758 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1037Q7TR84 321 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp2c1Q80XR2 918 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tomm70Q9CZW5 611 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ctps1P70698 591 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Grik1Q60934 836 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Maml1Q6T264 1020 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ubash3bQ8BGG7 638 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GmppbQ8BTZ7 360 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SykP48025 629 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nqo1Q64669 274 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ttc39cQ8VE09 580 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam47eD3YWC7 402 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AprtP08030 180 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gtf2bP62915 316 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mbtd1Q6P5G3 631 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 HltfQ6PCN7 1003 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q8CCC3 530 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GldcQ91W43 1025 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mtnd2P03893 345 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Acvr2bP27040 536 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rfx2P48379 717 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MipP51180 263 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NcstnP57716 708 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Csnk2bP67871 215 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Plk1Q07832 603 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ifit3Q64345 403 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Styk1Q6J9G1 429 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fndc11Q80WB0 326 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Luzp2Q8BGY3 345 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp6v1hQ8BVE3 483 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hist1h2aaQ8CGP4 129 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kifc1Q9QWT9 674 aa15.54■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slit3Q9WVB4 1523 aa15.53■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Skint3A7TZF0 458 aa15.53■□□□□ 0.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vti1bO88384 232 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.6 ms