RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638372.1

SCARB2-208, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-208ENST00000638372 CHRNB3Q05901 458 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CTBP1Q13363 440 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MECRQ9BV79 373 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ICAM3P32942 547 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TAF5Q15542 800 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ITIH5Q86UX2 942 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CDRT15Q96T59 188 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NDNQ99608 321 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SEMA3CQ99985 751 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ALG9Q9H6U8 611 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CCDC166P0CW27 439 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SLC2A4P14672 509 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CCNG1P51959 295 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 KCNJ2P63252 427 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SP3Q02447 781 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 WLSQ5T9L3 541 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CNTNAP1P78357 1384 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ADRA1BP35368 520 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PKNOX1P55347 436 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CYP51A1Q16850 503 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PGS1Q32NB8 556 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 P3H2Q8IVL5 708 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SEPHS2Q99611 448 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PARVBQ9HBI1 364 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ITGA2BP08514 1039 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 OR4Q2P0C623 313 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ELNP15502 786 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CYP2C18P33260 490 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CDKN2BP42772 138 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 STARD3Q14849 445 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NOMO1Q15155 1222 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 TSPAN1O60635 241 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 FKBP6O75344 327 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ZMPSTE24O75844 475 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CKBP12277 381 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 TSPAN8P19075 237 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 QPCTQ16769 361 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PFKFB4Q16877 469 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 UCMAQ8WVF2 138 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 JADE3Q92613 823 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 RAD54BQ9Y620 910 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SH3BGRLO75368 114 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 HOXC6P09630 235 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PLD5Q8N7P1 536 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SYT17Q9BSW7 474 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SYBUQ9NX95 663 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms