RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 CLEC1BQ9P126 229 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CDH22Q9UJ99 828 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 FZD10Q9ULW2 581 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 I6L893 689 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 RBP3P10745 1247 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CCR1P32246 355 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 STX2P32856 288 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ADRA1BP35368 520 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 DPYSL3Q14195 570 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 PDK2Q15119 407 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 NOMO1Q15155 1222 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CA9Q16790 459 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SLC39A13Q96H72 371 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SGSM3Q96HU1 749 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GKN1Q9NS71 199 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MMRN1Q13201 1228 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 KRT81Q14533 505 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GPR158Q5T848 1215 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 Q7L0L9 218 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GPR149Q86SP6 731 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GDAP1Q8TB36 358 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TEKT4Q8WW24 435 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MAGEB18Q96M61 343 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 FETUBQ9UGM5 382 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 EYSQ5T1H1 3165 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 E7ESA3 106 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 ZNF197O14709 1029 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 SNX3O60493 162 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 TBX10O75333 385 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 OLFM2O95897 454 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 KCNQ1P51787 676 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 PPP2R5DQ14738 602 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 ITFG1Q8TB96 612 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 ING5Q8WYH8 240 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 NTAN1Q96AB6 310 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 CKMP06732 381 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 SLC18A1P54219 525 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 GPX6P59796 221 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 COG7P83436 770 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 EFHC2Q5JST6 749 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 RNF157Q96PX1 679 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.865e-6■■■□□ 18.8
CLN8-208ENST00000635751 IGLV3-27P01718 113 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 TSHRP16473 764 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 CEBPBP17676 345 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 LTBRP36941 435 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 IL9RQ01113 521 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 GAD2Q05329 585 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 NPNTQ6UXI9 565 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 VSIG1Q86XK7 387 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 PDIK1LQ8N165 341 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 MYLIPQ8WY64 445 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 TRABDQ9H4I3 376 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 TASP1Q9H6P5 420 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms