RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	TPP1	O14773	563 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MAGEB2	O15479	319 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	APOC2	P02655	101 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SREBF1	P36956	1147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SNX17	Q15036	470 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	HTRA1	Q92743	480 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ART4	Q93070	314 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CALCA	P01258	141 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CTSH	P09668	335 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CDH17	Q12864	832 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGEF7	Q14155	803 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT73	Q86Y46	540 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KLK14	Q9P0G3	267 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	HDAC3	O15379	428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ENDOD1	O94919	500 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GLP2R	O95838	553 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CCR1	P32246	355 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ABAT	P80404	500 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DPP10	Q8N608	796 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	WFS1	O76024	890 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SERPINA6	P08185	405 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MSH3	P20585	1137 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GCNT1	Q02742	428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	LPAR1	Q92633	364 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZFP42	Q96MM3	310 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MBOAT7	Q96N66	472 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CGRRF1	Q99675	332 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DPP3	Q9NY33	737 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TMCC2	O75069	709 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SCNN1B	P51168	640 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ALF	Q53S48	1182 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF605	Q86T29	641 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ELMO1	Q92556	727 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	C3orf18	Q9UK00	162 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TISP43	B9A030	160 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNQ2	O43526	872 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GLRA2	P23416	452 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KLRK1	P26718	216 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CCNF	P41002	786 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CENPA	P49450	140 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SEPHS1	P49903	392 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CNTN1	Q12860	1018 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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