RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 DENND1BQ6P3S1 775 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM110Q86TL2 294 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 IQCHQ86VS3 1027 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MED15Q96RN5 788 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CYTH4Q9UIA0 394 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 DMTF1Q9Y222 760 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNU1A8MYU2 1149 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MED7O43513 233 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEC1O60732 1142 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RTN2O75298 545 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT5P13647 590 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CKMT2P17540 419 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R2P41236 205 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 OXCT1P55809 520 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNH2Q12809 1159 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 OVGP1Q12889 678 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 AGBL4Q5VU57 503 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ISM2Q6H9L7 571 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXR2Q6PJQ5 311 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 DSG4Q86SJ6 1040 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM69Q86WT6 500 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF606Q8WXB4 792 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RFFLQ8WZ73 363 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 OR8D1Q8WZ84 308 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ALG14Q96F25 216 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TIGD1Q96MW7 591 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 THAP9Q9H5L6 903 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PRORYQ9H606 182 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MAN1B1Q9UKM7 699 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SARDHQ9UL12 918 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 AK5Q9Y6K8 562 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ALOX15BO15296 676 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RRP8O43159 456 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP9BO43861 1147 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC2A3P11169 496 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ACP1P24666 158 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CCR1P32246 355 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CENPCQ03188 943 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PDCLQ13371 301 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 STAT4Q14765 748 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TAF5Q15542 800 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PROX2Q3B8N5 592 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ACCSLQ4AC99 568 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RABGAP1LQ5R372 815 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM46CQ5VWP2 391 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXL22Q6P050 247 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM59Q8IWR1 403 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52K2Q8NGK3 314 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM204AQ9H8W3 233 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A13Q9UJS0 675 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PPM1HQ9ULR3 514 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 KALRNO60229 2985 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 BICDL2A1A5D9 508 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TK2O00142 265 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MCF2LO15068 1137 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 THAP12O43422 761 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SDC3O75056 442 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 AFPP02771 609 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PRB1P04280 392 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 GLI1P08151 1106 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 BMP6P22004 513 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 GNA15P30679 374 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MARSP56192 900 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CDK17Q00537 523 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CNTN1Q12860 1018 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 DLG2Q15700 870 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 POM121L1PQ3SYA9 428 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZVU0 165 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB106AQ8N104 65 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms