RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-225	ENST00000593072	PTPRB	P23467	1997 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	IRAK2	O43187	625 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LAT	O43561	262 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	KLRC4	O43908	158 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	TNFSF15	O95150	251 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MBD3	O95983	291 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CALCA	P01258	141 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CKMT1A	P12532	417 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PDGFRA	P16234	1089 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	TGM2	P21980	687 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NR2F2	P24468	414 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DRD3	P35462	400 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DAOA	P59103	153 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CNTN1	Q12860	1018 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LRMP	Q12912	555 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CDKN3	Q16667	212 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ISX	Q2M1V0	245 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	IQCH	Q86VS3	1027 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR13H1	Q8NG92	308 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NOX5	Q96PH1	765 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAB20	Q9NX57	234 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DMTF1	Q9Y222	760 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	KNL1	Q8NG31	2342 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1W2PQU0	124 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NEMP2	A6NFY4	417 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072		K7ESM1	405 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	EFS	O43281	561 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	GABBR2	O75899	941 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PIAS2	O75928	621 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PCDH8	O95206	1070 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LTF	P02788	710 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	GIMD1	P0DJR0	217 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SYK	P43405	635 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	OVGP1	Q12889	678 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CLN3	Q13286	438 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ADAM9	Q13443	819 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LINC00303	Q3SY05	128 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	KRT39	Q6A163	491 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PMF1	Q6P1K2	205 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	GUSBP11	Q6P575	273 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072		Q6ZSR6	202 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	USP53	Q70EK8	1073 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CHSY1	Q86X52	802 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	JAML	Q86YT9	394 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	KDM1B	Q8NB78	822 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	EXTL1	Q92935	676 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PAGE5	Q96GU1	130 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SPAG5	Q96R06	1193 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-225	ENST00000593072	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-225	ENST00000593072	MGA	Q8IWI9	3026 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFTUD2-225	ENST00000593072	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		6.52	□□□□□ -1.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms