RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ARMCX2Q7L311 632 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 DPH6Q7L8W6 267 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ERO1BQ86YB8 467 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 DSELQ8IZU8 1212 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LEMD2Q8NC56 503 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 BEST2Q8NFU1 509 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 URGCPQ8TCY9 931 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPEARQ8WU66 669 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 JDP2Q8WYK2 163 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ROPN1LQ96C74 230 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TNIP3Q96KP6 325 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF778Q96MU6 729 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR22Q99680 433 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RHOJQ9H4E5 214 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR41Q9HAD4 459 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 DPP3Q9NY33 737 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 DTLQ9NZJ0 730 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 BTBD7Q9P203 1132 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LACTBL1A8MY62 500 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCB7O75027 752 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RAD17O75943 681 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ESRRBO95718 433 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 F9P00740 461 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CXCL8P10145 99 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC7A1P30825 629 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 NOS2P35228 1153 aa7.87□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 RHDQ02161 417 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SP4Q02446 784 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXM1Q08050 763 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 BNIP2Q12982 314 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PTK2BQ14289 1009 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SNX17Q15036 470 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TLR1Q15399 786 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.87□□□□□ -1.15
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CAPNS1-202ENST00000586851 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LPCAT4Q643R3 524 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 JADE1Q6IE81 842 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT80Q6KB66 452 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GALNT7Q86SF2 657 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 HPS6Q86YV9 775 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC22A9Q8IVM8 553 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 DCLK2Q8N568 766 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO27Q8NI29 283 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CALML6Q8TD86 181 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 STYXQ8WUJ0 223 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.87□□□□□ -1.15
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