RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 ACCSLQ4AC99 568 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ALFQ53S48 1182 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 IL27RAQ6UWB1 636 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 NAXDQ8IW45 347 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 AADATQ8N5Z0 425 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 VPS28Q9UK41 221 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SNX11Q9Y5W9 270 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ADH1BP00325 375 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 CHRNB2P17787 502 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 C5AR1P21730 350 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 JAM2P57087 298 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 TEAD4Q15561 434 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 LAYNQ6UX15 382 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF677Q86XU0 584 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 EBF2Q9HAK2 575 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ANO10Q9NW15 660 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 FZD4Q9ULV1 537 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 DRGXA6NNA5 263 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 KCNK3O14649 394 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 GOT1P17174 413 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SOX5P35711 763 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 GRIA4P48058 902 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 METAP1P53582 386 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 FMO1Q01740 532 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 CDR2Q01850 454 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 DLG2Q15700 870 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 C1orf74Q96LT6 269 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 MUC3BQ9H195 1237 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 MPP6Q9NZW5 540 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 DOCK9Q9BZ29 2069 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SPEGQ15772 3267 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 LRRC72A6NJI9 287 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ATP9BO43861 1147 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 KRT37O76014 449 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 C1QTNF9P0C862 333 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF883P0CG24 379 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SYCP1Q15431 976 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ARTNQ5T4W7 220 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 LRRC31Q6UY01 552 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 BNIPLQ7Z465 357 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 EMC1Q8N766 993 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 OR14C36Q8NHC7 312 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SPAG5Q96R06 1193 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 PSMB7Q99436 277 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SARDHQ9UL12 918 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 A0A1W2PPC4 97 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 PLK4O00444 970 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SRGAP2O75044 1071 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 CBFA2T3O75081 653 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 MT-CO1P00395 513 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 RHOCP08134 193 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 DRD3P35462 400 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 MYL5Q02045 173 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 STX1AQ16623 288 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 ARCQ7LC44 396 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM51Q9NW97 253 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.85■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.84■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 A0A0D9SEW6 157 aa21.84■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 C10orf142B7Z368 130 aa21.84■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 E9PAM4 449 aa21.84■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 BNIP3LO60238 219 aa21.84■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 SNAP91O60641 907 aa21.84■■□□□ 1.09
CSNK1D-215ENST00000580784 MMP8P22894 467 aa21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms