RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	THAP2	Q9H0W7	228 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	FBRS	Q9HAH7	460 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	DONSON	Q9NYP3	566 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	PI4KA	P42356	2102 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	PATE3	B3GLJ2	98 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	C7	P10643	843 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CDC25B	P30305	580 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	PCK1	P35558	622 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	COPA	P53621	1224 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	GALC	P54803	685 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	OGDH	Q02218	1023 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	H2AFV	Q71UI9	128 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	C14orf80	Q86SX3	495 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	TC2N	Q8N9U0	490 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	PANX2	Q96RD6	677 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM245	Q9H330	911 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	MTG2	Q9H4K7	406 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	SUN2	Q9UH99	717 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	INTU	Q9ULD6	942 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	FZD10	Q9ULW2	581 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	SLC30A4	O14863	429 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF217	O75362	1048 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM253	P0C7T8	217 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	SDHB	P21912	280 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ITPKA	P23677	461 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ETFB	P38117	255 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	GGCX	P38435	758 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CSK	P41240	450 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	MAPKAPK2	P49137	400 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	NUMB	P49757	651 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ST8SIA6	P61647	398 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ECT2L	Q008S8	904 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ARTN	Q5T4W7	220 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CACUL1	Q86Y37	369 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	APCDD1	Q8J025	514 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC185	Q8N715	623 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	NETO1	Q8TDF5	533 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CHP1	Q99653	195 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	EPAS1	Q99814	870 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	RTKN	Q9BST9	563 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	LAMA1	P25391	3075 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ILVBL	A1L0T0	632 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	MYO1F	O00160	1098 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	PRPSAP2	O60256	369 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	SRGAP2	O75044	1071 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	LRIG2	O94898	1065 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	RHOQ	P17081	205 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	FECH	P22830	423 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	OR1E1	P30953	314 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	NNMT	P40261	264 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	IRAK1	P51617	712 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	KRT83	P78385	493 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	IRX4	P78413	519 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF33A	Q06730	810 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	RAB6C	Q53S08	254 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	BOLA3	Q53S33	107 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBM23-231	ENST00000557549	ALF	Q53S48	1182 aa		12.65	□□□□□ -0.38

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