RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 DPP6P42658 865 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 AP3M2P53677 418 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TBCCQ15814 346 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 NXNQ6DKJ4 435 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 DCLK2Q8N568 766 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CCNYQ8ND76 341 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 RCN3Q96D15 328 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CATSPER2Q96P56 530 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 APBA2Q99767 749 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 NUF2Q9BZD4 464 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 DTLQ9NZJ0 730 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 KCNK1O00180 336 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 CSPG5O95196 566 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 LCP1P13796 627 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 AVPR1AP37288 418 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 MTTPP55157 894 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 FAM131BQ86XD5 332 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 CDHR1Q96JP9 859 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 PKP2Q99959 881 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 SNX15Q9NRS6 342 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 PLXNB2O15031 1838 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 FKTNO75072 461 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 LBX1P52954 281 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 RABGGTBP53611 331 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 RTP4Q96DX8 246 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 KATNBL1Q9H079 304 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 NME7Q9Y5B8 376 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 MYADML2A6NDP7 307 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TGM2P21980 687 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 SERPINB9P50453 376 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 GALK1P51570 392 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 FLOT2Q14254 428 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TTLL4Q14679 1199 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 WBP1LQ9NX94 342 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 MKS1Q9NXB0 559 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 PHF24Q9UPV7 400 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 ANK1P16157 1881 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TMEM233B4DJY2 109 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 FAM200BP0CF97 657 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TPH1P17752 444 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TNFAIP2Q03169 654 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 CEACAM7Q14002 265 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 IL31Q6EBC2 164 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 DSELQ8IZU8 1212 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 MCUQ8NE86 351 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 ATP2A3Q93084 1043 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 LRGUKQ96M69 825 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 NPAS2Q99743 824 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 HESX1Q9UBX0 185 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 SRRDQ9UH36 339 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 TK2O00142 265 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 ATP9BO43861 1147 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 MFSD11O43934 449 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 B4GALT4O60513 344 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 PDGFRBP09619 1106 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 PIK3R1P27986 724 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 ADORA2BP29275 332 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 MYBPC3Q14896 1274 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 BOLA3Q53S33 107 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-214ENST00000543184 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms