RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ARVCFO00192 962 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RASGRP1O95267 797 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ADRB2P07550 413 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 IYDQ6PHW0 289 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LONP2Q86WA8 852 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PHF21BQ96EK2 531 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZFP14Q9HCL3 533 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 USE1Q9NZ43 259 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GMIPQ9P107 970 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RIPK3Q9Y572 518 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM120BA0PK00 339 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 URADA6NGE7 173 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CRABP2P29373 138 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MAP2K2P36507 400 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 UBE3AQ05086 875 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ICE2Q659A1 982 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL35Q6PF15 583 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LBX2Q6XYB7 198 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DNAAF5Q86Y56 855 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KCNK16Q96T55 309 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCT7Q99832 543 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PARVBQ9HBI1 364 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 H3BM21 787 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KCNK1O00180 336 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KPNA5O15131 536 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SEC22BO75396 215 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ERN1O75460 977 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DAB1O75553 588 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FSBPO95073 299 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 VAPBO95292 243 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF682O95780 498 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 UQCRBP14927 111 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ACLYP53396 1101 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GTF2BQ00403 316 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MAPK7Q13164 816 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GRM3Q14832 879 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ACAP1Q15027 740 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CES3Q6UWW8 571 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PIGZQ86VD9 579 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC6Q86X45 466 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SCAIQ8N9R8 606 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 VCPIP1Q96JH7 1222 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CPNE1Q99829 537 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SYBUQ9NX95 663 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL3Q9UH77 587 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MAGEC1O60732 1142 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 AVILO75366 819 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCNDBP1O95273 360 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CALCAP01258 141 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GALNT3Q14435 633 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCNG2Q16589 344 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C3orf20Q8ND61 904 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 COL26A1Q96A83 441 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 VAT1Q99536 393 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DUSP16Q9BY84 665 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SRRDQ9UH36 339 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MRC1P22897 1456 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ARL5CA6NH57 179 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CES2O00748 559 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CFIP05156 583 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KRT8P05787 483 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 UMPSP11172 480 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CXCR2P25025 360 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GPR15P49685 360 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RALGDSQ12967 914 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 USP4Q13107 963 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ALG11Q2TAA5 492 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KCNB2Q92953 911 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms