RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530368.1

RRM1-208, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 5

Gene RRM1, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-208	ENST00000530368	PRKCH	P24723	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	HNF1B	P35680	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	GGT5	P36269	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368		Q9N2J8	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SGPL1	O95470	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	LATS1	O95835	1130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	GSTM2	P28161	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	ABCD3	P28288	659 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	MPG	P29372	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	ELF1	P32519	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	RHAG	Q02094	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	FOXF2	Q12947	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	PGM5	Q15124	567 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	KAT2A	Q92830	837 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	TBX18	O95935	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CDK4	P11802	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CERS1	P27544	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	KRT9	P35527	623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	DDIT3	P35638	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	PTPN9	P43378	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	MTNR1A	P48039	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	GPR68	Q15743	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	KAT2B	Q92831	832 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368		B4E171	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CELA2A	P08217	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	TSPAN7	P41732	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	OAZ1	P54368	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	CASP6	P55212	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	BAK1	Q16611	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRM1-208	ENST00000530368	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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