RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526255.1

RCOR3-208, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 1 (best)

Gene RCOR3, Length 909 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-208	ENST00000526255	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	MSH6	P52701	1360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	A2M	P01023	1474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	KDM5C	P41229	1560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CES2	O00748	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TIMM44	O43615	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	KAT7	O95251	611 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	C1R	P00736	705 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TPM2	P07951	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	NR2F6	P10588	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CPA1	P15085	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ARSA	P15289	507 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CHM	P24386	653 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	LMO1	P25800	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ADRA1B	P35368	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	GRIA3	P42263	894 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CDK18	Q07002	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	LRP6	O75581	1613 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MED14	O60244	1454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RGS12	O14924	1447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255		A0A1W2PQM1	296 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255		A6NCN8	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PEX12	O00623	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SPTLC2	O15270	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ESRRB	O95718	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NUDT3	O95989	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CLEC3B	P05452	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NPS	P0C0P6	89 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HKR1	P10072	659 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	AVPR2	P30518	371 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CYP2C18	P33260	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MPL	P40238	635 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CCR9	P51686	369 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PDE1A	P54750	535 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SEC23B	Q15437	767 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MEA1	Q16626	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms