RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522115.6

PTPN12-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 5

Gene PTPN12, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-215	ENST00000522115	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115		Q9N2J8	555 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN12-215	ENST00000522115		E7EVH7	732 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	HOXB2	P14652	356 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC16A2	P36021	539 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	PNPLA4	P41247	253 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	PRKG1	Q13976	671 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	LPAR1	Q92633	364 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	TCEA3	O75764	348 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	TK1	P04183	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ACP5	P13686	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	TYK2	P29597	1187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	PRKAA2	P54646	552 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	P2RX3	P56373	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	GAD2	Q05329	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115		Q5PR19	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	METTL18	O95568	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	PRKCH	P24723	683 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	GSTM2	P28161	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	FHL1	Q13642	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	PKP1	Q13835	747 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	EFR3A	Q14156	821 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	POSTN	Q15063	836 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-215	ENST00000522115	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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