RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520489.5

BIN3-208, Transcript of bridging integrator 3, human

TSL 2

Gene BIN3, Length 3,589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BIN3-208	ENST00000520489	GBA3	Q9H227	469 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	WDR27	A2RRH5	827 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	IGLV3-25	P01717	112 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	APRT	P07741	180 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CCDC166	P0CW27	439 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SDC4	P31431	198 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HTR7	P34969	479 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PHKA2	P46019	1235 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ANKFN1	Q8N957	763 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CDKL2	Q92772	493 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ASB9	Q96DX5	294 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	GJD2	Q9UKL4	321 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	GABRD	O14764	452 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	BMP10	O95393	424 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	LRP8	Q14114	963 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PSMD5	Q16401	504 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	LIPM	Q5VYY2	423 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF567	Q8N184	647 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	GBP5	Q96PP8	586 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF639	Q9UID6	485 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HDAC3	O15379	428 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TIMM44	O43615	452 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CRTAM	O95727	393 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF23	P17027	643 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PIK3R1	P27986	724 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HOXC8	P31273	242 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	BCAT1	P54687	386 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	NFKB2	Q00653	900 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PPIL2	Q13356	520 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	C16orf46	Q6P387	395 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	KDM1B	Q8NB78	822 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	P2RY11	Q96G91	374 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	GGA3	Q9NZ52	723 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	MTSS1	O43312	755 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TNFAIP8	O95379	198 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	MYL3	P08590	195 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ADRA1A	P35348	466 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	KRT81	Q14533	505 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	MROH9	Q5TGP6	573 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CCDC185	Q8N715	623 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HM13	Q8TCT9	377 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ATP2A3	Q93084	1043 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SYBU	Q9NX95	663 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	MFSD11	O43934	449 aa		10.77	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	IGHA2	P01877	340 aa		10.77	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	POLB	P06746	335 aa		10.77	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SPATA31D3	P0C874	917 aa		10.77	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	RAG1	P15918	1043 aa		10.77	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SLC26A3	P40879	764 aa		10.77	□□□□□ -0.68

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