RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 FMO1Q01740 532 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CREB5Q02930 508 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CHI3L2Q15782 390 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 NRF1Q16656 503 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CNKSR3Q6P9H4 555 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 GPD1LQ8N335 351 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ITPKCQ96DU7 683 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 KIF12Q96FN5 646 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 AQP9O43315 295 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FAM155BO75949 473 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 MAPTP10636 758 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ITGAXP20702 1163 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 GABRB3P28472 473 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ARL2P36404 184 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 COPAP53621 1224 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FAAP100Q0VG06 881 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FRMD7Q6ZUT3 714 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 IQCF2Q8IXL9 164 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D15Q8TC07 691 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 BORCS5Q969J3 196 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 APOPT1Q96IL0 206 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 DHRS4Q9BTZ2 278 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SLC2A11Q9BYW1 496 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM117Q9H0C3 514 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM134Q9H6X4 195 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf88Q9H8K7 445 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PSMD13Q9UNM6 376 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PI4K2BG5E9Z4 385 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF12P17014 697 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ACOT2P49753 483 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PHKG1Q16816 387 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 EPC2Q52LR7 807 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SH2D5Q6ZV89 423 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 GPR180Q86V85 440 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TICAM1Q8IUC6 712 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 KLK14Q9P0G3 267 aa10.32□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 OGTO15294 1046 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CENPCQ03188 943 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 BNIP3Q12983 259 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FBXO47Q5MNV8 452 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ZPBP2Q6X784 338 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM72Q6ZMU5 477 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CENPUQ71F23 418 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 THAP11Q96EK4 314 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM169Q96HH4 297 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 LRGUKQ96M69 825 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 EHD1Q9H4M9 534 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SLC28A3Q9HAS3 691 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 IL23AQ9NPF7 189 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 RIMS3Q9UJD0 308 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 GTF3C4Q9UKN8 822 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CEP290O15078 2479 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0B4J269 797 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PPW3 197 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 I3L4J1 428 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SULT1C4O75897 302 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 IFNB1P01574 187 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 OR1G1P47890 313 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TUBB3Q13509 450 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FGD3Q5JSP0 725 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 METTL23Q86XA0 190 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FBXW8Q8N3Y1 598 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 UBE4BO95155 1302 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 KRBA1A5PL33 1030 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 INHBBP09529 407 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 NR4A1P22736 598 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 EPHA3P29320 983 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PRDX6P30041 224 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 BMXP51813 675 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TAS2R40P59535 323 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 IRX4P78413 519 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 KCNC4Q03721 635 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TEX44Q53QW1 395 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 B3GNT9Q6UX72 402 aa10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms