RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 RFC2P35250 354 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CCNFP41002 786 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ETV4P43268 484 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PSEN1P49768 467 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NAB1Q13506 487 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CRYMQ14894 314 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 AFMIDQ63HM1 303 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF449Q6P9G9 518 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA21Q7Z572 469 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF276Q8N554 614 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 VPS11Q9H270 941 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 UGT1A7Q9HAW7 530 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 UGT1A10Q9HAW8 530 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 UGT1A8Q9HAW9 530 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 COMMD8Q9NX08 183 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MKS1Q9NXB0 559 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FNIP2Q9P278 1114 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RFPL1O75677 317 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 VNN2O95498 520 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 JCHAINP01591 159 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 POLBP06746 335 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 YWHAQP27348 245 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEA9P43362 315 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TUBP50607 506 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TBX4P57082 545 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC3Q13217 504 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CNPY4Q8N129 248 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC43Q8N309 656 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CNTD1Q8N815 330 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CDKL2Q92772 493 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO32Q969P5 355 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IL12RB2Q99665 862 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 COL4A6Q14031 1691 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 HMX2A2RU54 273 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DFFAO00273 331 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MAFKO60675 156 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FSBPO95073 299 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 EFEMP2O95967 443 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CCNB1P14635 433 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PBX3P40426 434 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ARPP19P56211 112 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 OLIG2Q13516 323 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 C14orf80Q86SX3 495 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM135Q86UB9 458 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CHSY1Q86X52 802 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 UNC5BQ8IZJ1 945 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GPR152Q8TDT2 470 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SPOCK2Q92563 424 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TTPALQ9BTX7 342 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IL23AQ9NPF7 189 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 BFARQ9NZS9 450 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.37□□□□□ -1.07
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