RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 HIC2Q96JB3 615 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NOX5Q96PH1 765 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CPXM1Q96SM3 734 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 LGMNQ99538 433 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 GABRG3Q99928 467 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR174Q9BXC1 333 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 LHX5Q9H2C1 402 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ANO10Q9NW15 660 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CEP83Q9Y592 693 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NBASA2RRP1 2371 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NPC1O15118 1278 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 IRAK2O43187 625 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 EFSO43281 561 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SUV39H1O43463 412 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TIMM44O43615 452 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ACSL4O60488 711 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFS2O75306 463 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 IGLV3-25P01717 112 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 APOEP02649 317 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 GLI1P08151 1106 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 UCHL3P15374 230 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC6A4P31645 630 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SGSHP51688 502 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TMPRSS3P57727 454 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SNX16P57768 344 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 MYL5Q02045 173 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ENPP2Q13822 863 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 KRT31Q15323 416 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SHBQ15464 509 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 MPP7Q5T2T1 576 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TAC4Q86UU9 113 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC39A13Q96H72 371 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CIPCQ9C0C6 399 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS16Q9H269 839 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 FANCLQ9NW38 375 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 POLQO75417 2590 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PDZD2O15018 2839 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 ENO4A6NNW6 628 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 METTL12A8MUP2 240 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 MEI4A8MW99 385 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 F8VZ95 297 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 ENC1O14682 589 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 TBL1XO60907 577 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 HSF2BPO75031 334 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF217O75362 1048 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 DAB1O75553 588 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 ERBB2P04626 1255 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP11B1P15538 503 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSPL-208ENST00000486978 CD6P30203 668 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms